気象庁の津波警報発表を受け、２８日午後９時半現在、ＪＲ各社の在来線で運転を見合わせている。

■ＪＲ北海道

　函館線：函館～長万部
　室蘭線：長万部～苫小牧
　日高線：全線
　根室線：池田～釧路
　花咲線：全線
　釧網線：釧路～川湯温泉
　江差線：全線
　津軽海峡線：全線

　特急「スーパー北斗」の全線
　特急「スーパー青空」「スーパー白鳥」「すずらん」の一部区間

■ＪＲ東日本

　鶴見線：鶴見～扇町以外の支線
　内房線：千倉～安房鴨川
　外房線：勝浦～安房鴨川
　東北本線：仙台～小牛田
　常磐線：仙台～原ノ町
　仙石線：東塩釜～石巻
　石巻線：石巻～女川
　気仙沼線：小牛田～気仙沼
　八戸線：八戸～久慈
　津軽線：蟹田～三厩
　釜石線：花巻～釜石
　山田線：盛岡～宮古、宮古～釜石
　岩泉線：宮古～岩泉
　大船渡線：気仙沼～盛
　五能線：能代～鰺ヶ沢

　「北斗星」や「トワイライトエクスプレス」などの夜行列車は運休。

■ＪＲ東海

　紀勢線：大内山～新宮
　参宮線：伊勢市～鳥羽
　東海道線：富士～静岡、浜松～豊橋

　特急列車「ワイドビュー南紀」「快速みえ」「ワイドビューふじかわ」は運転見合わせや部分運休。

■ＪＲ西日本

　紀勢線：和歌山～新宮

　京都駅と新大阪駅から和歌山、白浜、新宮方面に向かう特急「オーシャンアロー」「スーパーくろしお」「くろしお」の一部の列車で運転見合わせ。

■ＪＲ四国

　予讃線：八幡浜～宇和島
　土讃線：阿波池田～窪川
　高徳線：引田～徳島
　牟岐線：全線
　鳴門線：全線
　徳島線：徳島～穴吹
　予土線：江川崎～宇和島

■ＪＲ九州

　日豊線：大分～南宮崎、国分～鹿児島中央
　指宿枕崎線：五位野～枕崎
　日南線：全線
　宮崎空港線：全線