気象庁によると、３日午前３時６分までに観測された津波の時刻と高さは次の通り。

　八丈島八重根では午前２時３５分に０．５メートル。三宅島坪田では午前２時５３分に０．２メートル。三宅島阿古では午前２時４８分に０．２メートル。神津島港では午前３時０分に０．１メートル。

　場所によっては検潮所で観測される津波よりも大きな津波が到達する可能性もある。今後、津波の高さはさらに高くなることも考えられる。津波による潮位変化が観測されてから最大波が観測されるまでに数時間以上かかることがある。