東京マラソン財団は、２０２０年から東京マラソンの参加料を５０００円値上げし、１万５０００円（税抜き）にすることを決めた。

財団によると、２０１３年にアメリカのボストンマラソンで爆破テロが起きて以来、警備費用などが増えていることから、参加料を値上げして、大会のテロ対策・警備費用にあてるという。

２００７年に始まった第１回大会以来、参加料の値上げは初めてで、２０２０年の大会は消費税８％を適用し、国内ランナーの参加料は、１万６２００円（税込み）となる。