２日の九州に続き、３日は中国、四国や近畿などで梅雨入りの発表があった。一方、２日に梅雨入りした熊本県は、３日も南部を中心に激しい雨が降っている。土砂災害の危険が高まっている天草市では１万４７７４人に避難勧告が出された。

　天草市牛深地区では、降り始めの２日午前１１時から３日午前１０時までの総雨量が２１９ミリに達していて、気象台は、牛深地区を含む天草市西部に土砂災害警戒情報を出した。これを受け、天草市は牛深地区の６９８１世帯、１万４７７４人に対し避難勧告を出した。

　八代市西部や芦北町、球磨村にも土砂災害警戒情報が出され、八代市は約２万５０００人に避難準備情報を発令した。また、八代市坂本町では道路の土砂崩れのため、１５世帯、２４人が孤立している。