台風の特別警報は台風の接近によって引き起こされる暴風や波浪、高潮に最大級の警戒を呼びかけるもので、中心気圧９３０ｈＰａ以下、または最大風速５０メートル以上、の極めて危険な台風が接近した場合に発表されます。

台風災害に慣れている沖縄や奄美では、基準が高く設定されており、中心気圧９１０ｈＰａ以下、または最大風速６０メートル以上となります。

すでに災害が発生しているタイミングで出されることが多い、警戒レベル５の「大雨特別警報」とは違い、台風の特別警報は、台風が最も接近するおおむね１２時間前に出されます。

気象庁は、台風の特別警報が出された段階でまだ避難が完了していない人は、地元の自治体が出す避難情報に従い、急いで避難行動を取るよう求めています。