地震の影響でJR東日本は、1月2日（火）の新幹線や在来線について運転見合わせや運休が発生すると発表しました。
設備の点検状況などによって運転計画が変わる可能性があるとしています。
バスなどによる代行輸送はありません。

【上越新幹線】
・東京駅～越後湯沢駅・ガーラ湯沢駅　上下線　遅れや運休の可能性

・越後湯沢駅～新潟駅　上下線　午前中は運転見合わせ　
※点検状況により午後も運転取りやめの可能性

【北陸新幹線】
・東京駅～長野駅　上下線　遅れや運休の可能性

・長野～金沢駅　上下線　午前中は運転見合わせ
※点検状況により午後も運転を取りやめの可能性

【東北新幹線】
・平常通り


JR新潟支社による在来線の情報です。

【信越本線】
・長岡駅～新潟駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ
・直江津駅～長岡駅　始発から上下線で終日運転見合わせ

【白新線・羽越本線】
・新潟駅～新発田駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ
・新津駅～酒田駅　　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ

【上越線】
・水上駅～長岡駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ

【磐越西線】
・喜多方駅～新津駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ

【越後線】
・内野駅～新潟駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ
・柏崎駅～内野駅　始発から終日上下線で運転見合わせ

【弥彦線】
・弥彦駅～東三条駅　始発から終日上下線で運転見合わせ

【飯山線】
・森宮野原駅～越後川口駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ

【只見線】
・只見駅～小出駅　始発から夕方頃まで上下線　運転見合わせ