１３日午前５時３３分頃に兵庫・淡路市で震度６弱を観測した地震を受け、首相官邸に入った菅官房長官は同日早朝、記者団の取材に応じ、「各省庁から報告を受けたが、今のところ、大きな被害はない。原発も異常ない、道路にも大きな被害はないと聞いている」と話した上で、「これからも情報収集していく」と強調した。

　また、午前５時４０分に安倍首相から危機管理監に被害状況の確認に万全を期すよう、被害者の救助救出に全力を尽くすよう指示があったことを明らかにした。