国会で菅首相は、日本学術会議の問題をめぐり、任命拒否をした要因として、これまで学術会議と内閣府で行っていた人事の事前調整がなかったことをあげました。

自民党・二之湯議員「人事のプロセスの詳細は言えないでしょうが、この際ですね、言える範囲内で説明していただいたほうが国民にわかりやすいのではないかと思います」

菅首相「以前は、学術会議が正式の推薦名簿が提出される前に、内閣府の事務局などと学術会議の会長との間に一定の調整が行われていたと承知してます。一方、今回の任命に当たっては、そうした推薦前の調整が働かず、結果として学術会議から推薦された者の中に任命に至らなかったものが生じたということです」

一方、野党側は、任命拒否により欠員が生じていることは定員を定めている法律に違反しているとして６人の任命を求めています。

これに対し菅首相は、「過去にも定員が足りないことはあった」と述べ違法ではないとの認識を示しました。また、学術会議が６人を改めて推薦した場合の対応については「仮定の話になるので発言は控える」と述べるにとどめました。