３日夕方、熊本県和水町で震度６弱の地震があった。運転を見合わせていた九州新幹線は、４日朝の始発から運転を再開した。

３日午後６時過ぎに強い地震があり、和水町で震度６弱、熊本市北区と玉東町で震度５弱を観測した。和水町では、小学校の窓ガラスが割れたり、神社の鳥居の一部が落下したりしたほか、４日朝、町の調査で国の史跡に指定されている「江田船山古墳」の石棺の一部で被害が出ている可能性があることが分かった。

また、県によると和水町などで合わせて３２人が避難。益城町では８７歳の女性が自宅で転び軽いけがをした。

一方、九州新幹線は３日、博多－熊本間で終日運転を見合わせ、上下４０本が運休、約１万人に影響が出た。４日朝、運転を再開した九州新幹線。上り線は始発からほぼ満席だという。