２０１３年に海上自衛隊の潜水艦内で乗組員の４０歳代の隊員が拳銃で自殺未遂した問題で、中谷防衛相は、当時の上官らによる暴力が原因だったとして謝罪した。

　中谷防衛相「前途有為な自衛隊員に対して、上官が暴力をともなう不適切な指導によって自殺未遂にいたらしめたということについては、防衛大臣として申し訳なく、心からお詫びを申し上げたい」

　海上自衛隊は、自殺未遂をした隊員の当時の上官を停職１０日とし、他２名の隊員について懲戒処分とした事を発表した。

　中谷防衛相は、「今後、不適切な指導が行われないよう、服務指導を強化し、再発防止に努めたい」と述べた。